حکومت ترکیه در نظر دارد که مکاتب ترک را در بیرون از مرزهای آن کشور ببندد که مکاتب افغان – ترک نیز شامل این تصمیم می‌شود.
اسدالله حنیف بلخی وزیر معارف افغانستان با نگرانی از بسته شدن مکاتب افغان – ترک گفت: “تاکنون حکومت ترکیه رسماً تقاضای بستن مکاتب افغان ترک را نکرده است”.
اما بشیر احمد ته‌ینج سخنگوی حزب جنبش به رهبری جنرال عبدالرشید دوستم معاون اول ریاست جمهوری گفت سفیر ترکیه در دیدار با مقام‌های این حزب از احتمال بسته شدن مکاتب افغان – ترک خبر داد.
آقای ته‌ینج گفت آقای دوستم که یکی از طرفداران مکاتب افغان – ترک است و اکنون در ترکیه به سر می‌برد، با مقام‌های ترک در تماس است تا با یک تلاش هماهنگ و روش بهتر، در مدیریت این مکاتب تغییر وارد کرده و از بسته شدن آن‌ها جلوگیری کند.
مکاتب ترکیه در بیرون از آن کشور، از سوی جریان فتح الله گولن حمایت و مدیریت می‌شود.
نخستین مکتب افغان ترک در سال ۱۹۹۵ در افغانستان گشایش یافت و در حال حاضر تعداد آن‌ها به ۲۰ باب می‌رسد که حدود ۸۵۰۰ شاگرد در این مکاتب درس می‌خوانند.