دفتر اداری رییس جمهور گفته است که بنابر درخواست بخش خصوصی تصمیم ادغام اداره آیسا با وزارت تجارت گرفته شده است و حکومت افغانستان این تصمیم را عملی می‌کند.
محمد اشرف غنی، رییس جمهور کشور در جلسه شورای ملی گفت: “وزارت تجارت و صنایع باید در مدت یک هفته مراحل تجدید مجوز تجارت را آغاز کند تا مشخص شود که این وزارت برای ادغام اداره آیسا آماده است یا نیاز به اقدامات بعدی دارد.
به گفته دفتر اداری رییس جمهور، ادغام اداره آیسا در دو مرحله صورت می‌گیرد که شامل صدور مجوز به وزارت تجارت و تغییر قانون تجارت و سرمایه گذاری می باشد.
باری رحمان، وزیر تجارت و صنایع کشور می‌گوید که هدف حکومت رسیدگی به تعهداتی است که با سازمان های بین المللی به‌خاطر ادغام اداره آیسا با وزارت تجارت نموده است، تا همه ارگان‌ها تحت کنترل دولت بوده و روند صدور مجوز آسان گردد.
اداره آیسا در سال۱۳۸۱ در چهارچوب کمیسیون عالی سرمایه‌گذاری افغانستان به منظور تشویق سرمایه‌گذاری و ایجاد سهولت در کار سرمایه‌گذاران داخلی و خارجی ایجاد شده بود.